BPK Sultra laksanakan sejumlah pemeriksaan kinerja yang terkait atas Pengelolaan Perizinan, Vaksinasi, Kebijakan Fiskal, Pendidikan dan Pelatihan Vokasi Berbasis Kerja Sama Dunia Usaha dan Dunia Industri, serta Program Perlindungan Sosial.
Tujuan dilaksanakannya tersebut antara lain adalah untuk memperoleh pemahaman tentang hal pokok/objek pemeriksaan seperti proses bisnis, risiko bawaan yang terkandung dalam isu-isu potensial, termasuk melakukan proses identifikasi terhadap beberapa hal yang terkait kerentanan entitas sebagai akibat lemahnya sistem pengendalian internal; masalah yang akan dilakukan pemeriksaan secara mendalam; menentukan area kunci yang akan menjadi fokus dalam pemeriksaan terinci pemeriksaan kinerja; merumuskan tujuan-tujuan potensial pemeriksaan dan memberikan alasan mengapa tujuan tertentu dinilai memegang prioritas tertinggi; menentukan lingkup pemeriksaan; kriteria yang dapat digunakan dalam pemeriksaan terinci; jenis dan sumber-sumber bukti yang diperlukan dalam pemeriksaan terinci; hingga memutuskan apakah suatu masalah layak untuk dilakukan pemeriksaan yang lebih mendalam dalam pemeriksaan terinci.